Зейская гидроэлектростанция работает с суммарным средним расходом до 2 500 кубометров в секунду. Уровень воды в верхнем бьефе равен 317,53 метра, уровень нижнего бьефа – 223,90 метра. Среднее значение притока за сутки – 2 423 кубометра в секунду.

Суммарный расход через гидроузел составляет 2 423 кубометра в секунду (в том числе: через турбины – 707 кубометров в секунду, через водослив – 1 715 кубометров в секунду).

По оперативным данным Росгидромета, прогноз притока в Зейское водохранилище в период с 24 по 26 сентября будет колебаться в диапазоне 3 500–4 700 кубометров в секунду.